Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EEFSECP57772 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms