Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms