Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO3P55854 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms