Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms