Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms