Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRABP1P29762 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms