Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCAP28676 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms