Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLD1P28340 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms