Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTSSP25774 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms