Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms