Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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