Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms