Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD58P19256 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD58P19256 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD58P19256 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD58P19256 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD58P19256 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD58P19256 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD58P19256 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD58P19256 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD58P19256 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms