Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODC1P11926 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODC1P11926 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODC1P11926 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms