Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms