Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3P10147 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms