Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA5P08648 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms