Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms