Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F6O75461 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms