Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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