Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms