Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms