Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DXG7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DXG7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DXG7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DXG7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DXG7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DXG7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DXG7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DXG7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms