Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms