Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRCP1A6NGW2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms