Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GMNCA6NCL1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMNCA6NCL1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms