Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POMPQ9Y244 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms