Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK2Q9UPX8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHANK2Q9UPX8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms