Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP18Q9UMW8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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