Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED23Q9ULK4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED23Q9ULK4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms