Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAX2Q9UIW0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms