Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms