Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DBF4Q9UBU7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms