Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLKQ9UBT6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms