Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP35Q9P2H5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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