Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDAP2Q9NXN4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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