Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEPPQ9NTK1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms