Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms