Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms