Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRDE2Q9H7Z3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms