Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM8Q9BZR9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms