Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSX2Q9BZM3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms