Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms