Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms