Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms