Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD5Q99666 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms