Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3R4Q99570 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3R4Q99570 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms