Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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