Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNAQ96QF7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms