Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms